Odpowiedź niepofałdowanego białka (UPR) jest mechanizmem komórkowym, który jest uruchamiany w celu radzenia sobie ze stresem spowodowanym nagromadzeniem nieprawidłowo sfałdowanych białek w siateczce endoplazmatycznej (ER). Ta odpowiedź jest inicjowana przez enzym 1 wymagający endorybonukleazy inozytolu (IRE1), aktywujący czynnik transkrypcyjny 6 (ATF6) i kinazę ER podobną do PKR, które zwiększają ekspresję genów zaangażowanych w procesy fałdowania i degradacji oraz zmniejszają ilość wprowadzanych białek do ER poprzez hamowanie translacji. Wykazano, że wirusy zarówno indukują, jak i manipulują UPR w celu ochrony komórek gospodarza przed śmiercią wywołaną stresem ER, umożliwiając w ten sposób translację białek wirusowych i wydajną replikację wirusa. Aby zrozumieć zdarzenia komórkowe zachodzące podczas cyklu replikacji rotawirusa, zbadaliśmy aktywację trzech ramion UPR po infekcji, używając reporterów lucyferazy kierowanych przez promotory genów reagujących na stres ER i PCR z odwrotną transkrypcją w czasie rzeczywistym w celu określenia poziomów mRNA wywołanych stresem. Nasze odkrycia wskazują, że podczas infekcji rotawirusem dwa z trzech ramion UPR (IRE1 i ATF6) zostają aktywowane; jednakże szlaki te są przerywane na poziomie translacji przez ogólne hamowanie syntezy białek spowodowanej przez NSP3. Wydaje się, że ta odpowiedź jest wyzwalana przez więcej niż jedno białko wirusowe syntetyzowane podczas replikacji wirusa, ale nie przez wirusowe dwuniciowe RNA (dsRNA), ponieważ komórki transfekowane wirionami inaktywowanymi psoralenem lub nagim wirusowym dsRNA nie wywołać UPR. wykorzystanie reporterów lucyferazy napędzanych promotorami genów reagujących na stres ER i PCR z odwrotną transkrypcją w czasie rzeczywistym w celu określenia poziomów mRNA wywołanych stresem. Nasze odkrycia wskazują, że podczas infekcji rotawirusem dwa z trzech ramion UPR (IRE1 i ATF6) zostają aktywowane; jednakże szlaki te są przerywane na poziomie translacji przez ogólne hamowanie syntezy białek spowodowanej przez NSP3
Komórki eukariotyczne napotykają na szereg fizjologicznych i środowiskowych stresujących warunków, które wymagają adaptacyjnych odpowiedzi w ekspresji genów; Obejmują one między innymi zmiany temperatury, ograniczenie składników odżywczych, urazy chemiczne, stres oksydacyjny, niedotlenienie i infekcje wirusowe. Ekspozycja komórek na stres wywołuje reakcje adaptacyjne, które wymagają skoordynowanej ekspresji genów odpowiedzi na stres, które wpływają na przeżycie, progresję cyklu komórkowego, różnicowanie i apoptozę ( 63 ). Retikulum endoplazmatyczne (ER) jest organellą, która integruje sygnały z całej komórki, aby zaaranżować skoordynowaną odpowiedź w takich sytuacjach ( 33 ). To właśnie w ER ma miejsce fałdowanie białek przeznaczonych zarówno dla organelli wewnątrzkomórkowych, jak i powierzchni komórki ( 5). Nagromadzenie nieprawidłowo sfałdowanych białek w ER powoduje stres i prowadzi do aktywacji skoordynowanego programu adaptacyjnego zwanego odpowiedzią niepofałdowanego białka (UPR) (przegląd w odnośnikach 17 i 26 ). Funkcją UPR jest radzenie sobie z niefałdowanymi białkami poprzez regulację w górę ekspresji białek opiekuńczych i czynników degradacji w celu ponownego fałdowania lub wyeliminowania nieprawidłowo sfałdowanych białek oraz zmniejszenie ruchu docierających białek do ER poprzez osłabienie translacji ( 50 ). Ważną funkcją UPR jest zmniejszenie zapotrzebowania na maszynę do składania białek w celu ochrony komórek przed stresem. Brak złagodzenia stresu ER prowadzi do aktywacji szlaków apoptotycznych i śmierci komórek ( 25). Trzy białka transbłonowe rezydentne w ER są aktywowane w odpowiedzi na stres ER: kinaza PKR-podobna (PERK), aktywujący czynnik transkrypcyjny 6 (ATF6) i enzym 1 wymagający inozytolu (IRE1
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3209385/
